醫院住院部的醫藥凈化工程區域，通常采用全空氣凈化空調系統，系統設計三個級別過濾。各重要潔凈室單獨設置一臺衛生型醫用空氣處理機組，走廊及輔助用房設置一臺醫用空氣處理機組。新風采用集中處理方式。送風通過初、中、高能效三個級過濾，新風機組初級（粗效+中效+亞高能效）；循環機組中效過濾，送風末端高能效過濾。

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   一、醫院住院部的醫藥凈化工程區域應保持有序壓差梯度和定向氣流。定向氣流應經滅除病菌區流向去污區。無菌存放區對相鄰并相通房間不應低于5Pa的正壓，去污區對相鄰并相通房間和室外均應維持不低于5Pa的負壓。

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   二、無菌存放區宜按不低于Ⅳ級潔凈用房設計，并應采用單獨的醫藥凈化工程空調系統。高壓滅除病菌容器應設置局部通風，低溫滅除病菌室應有單獨排風系統，溫度冬季不宜低于18℃，夏季不宜高于24℃；室內相對濕度冬季不宜低于30％，夏季不宜高于60％。

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   三、去污區應設置單獨局部排風醫藥凈化工程空調系統，總排風量不應低于負壓所要求的差值風量。去污區內的回風口應設置不低于中效的空氣過濾器。
   四、采用普通空調的區域冬季溫度不宜低于18℃，夏季溫度不宜高于26℃。