潔凈室建造好之后，在后期的使用過程中，也要注意潔凈室的潔凈度，更好的保證潔凈室的正常運行。

潔凈室空調工程

（1）保持潔凈室空調房間的正壓值。如果房間出現負壓或正壓值低于鄰室，室外和周圍房間的空氣便會由門窗縫滲入，尤其在凈化空調系統中，凈化等級高的要比其它房間的正壓值要高。醫藥設計潔凈度比非潔凈區至少大于10帕，不同潔凈度之間大于10帕。

（2）要保證潔凈室空調房間氣流組織的合理性。氣流組織如果被破壞，不但室內的溫度分布受影響，而且因為蝸流過多，使墻角、地面附近的不潔氣流擴散到室內工作區。因此，空調房間內的工作臺，設備的布置要考慮到氣流組織的合理性。設備不能把回風口擋住，回風口百葉嚴禁亂動。

（3）凈化房間一定要保證有三級過濾：粗、中、高、效過濾。要加強凈化空調的管理。工作人員應遵守制度和操作規程，保證室內的衛生達到凈化要求。

（4）經常或按期清洗、更換空氣過濾器，新風入中粗效、中效泡沫塑料過濾器要經常清洗。當中效過濾器的終阻是初阻的二倍或限定值時，應進行清洗。過濾器阻力過大時，應該更換。泡沫塑料過濾器清洗后，應該測定。

潔凈室空調工程系統

（5）保持空調處理設備，空調機房的清潔。

（6）定期測定室內的含塵量和正壓值。

我方在根據《中國藥典》2015年版第四部及《藥品生產質量管理規范（2010年修訂）》（GMP），對于B、C、D級潔凈室，采用非單向流，末端采用過濾效率99.995%-99.999%的H14過濾器，保證B級55次，C級25次，D級15次的換氣次數，利用潔凈空氣對房間內的空氣進行稀釋，以此來達到相應的潔凈度要求