由于一些行業(yè)主管部門(mén)在制訂驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)時(shí)，缺乏專(zhuān)門(mén)知識(shí)，對(duì)醫(yī)藥凈化車(chē)間潔凈室的原理和特點(diǎn)了解不夠，往往將醫(yī)藥凈化車(chē)間設(shè)計(jì)廠房過(guò)于神秘化，復(fù)雜化，因此對(duì)醫(yī)藥凈化車(chē)間設(shè)計(jì)平面布局過(guò)于苛刻，造成很多不必要的麻煩。
   首先是平面布置方面的問(wèn)題。這個(gè)問(wèn)題在藥廠潔凈車(chē)間廠房和生物實(shí)驗(yàn)室的平面設(shè)計(jì)中，尤為突出。主要的問(wèn)題就是平面過(guò)于復(fù)雜，的確在醫(yī)藥凈化車(chē)間設(shè)計(jì)平面中，應(yīng)盡量保證潔凈區(qū)不受污染，做到合理分區(qū)，潔污分開(kāi)，人流、物流明顯，但一定要避免矯枉過(guò)正。

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   這個(gè)問(wèn)題在緩沖室的設(shè)置上尤為突出。例如某藥廠人員進(jìn)入潔凈廠房的過(guò)程是這樣的：換鞋緩沖 洗手消菌緩沖 潔凈走廊緩沖 或高等級(jí)別潔凈室。由此，工作人員在進(jìn)入高等級(jí)別潔凈室工作前，需要進(jìn)出9個(gè)房間，開(kāi)啟關(guān)閉18扇門(mén)，其復(fù)雜程度可想而知。

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   另外，很多藥廠由于規(guī)模小投資少，醫(yī)藥凈化車(chē)間設(shè)計(jì)廠房十分緊湊，以至于每間輔助間的面積只有幾平方米，甚至只有2平方米，于是工作人員在幾乎不能同時(shí)容下2人的房間里，不停的開(kāi)門(mén)、轉(zhuǎn)身、關(guān)門(mén)，以至于近乎暈頭轉(zhuǎn)向。
   要求嚴(yán)格是好事，但如果矯枉過(guò)正就會(huì)適得其反，很多工人為了進(jìn)出方便，往往很多門(mén)都不關(guān)，很多房間形同虛設(shè)。將可以合并的房間合并，將沒(méi)有必要設(shè)置的房間取消，是解決這一問(wèn)題的辦法。