凈化無塵車間工程項目施工完成后，通常要進行一系列的檢測，以判斷凈化無塵車間工程是否合格。潔凈度是凈化無塵車間工程項目檢測中，特別核心的指標，凈化無塵車間工程潔凈度檢測的方法是：對凈化無塵車間工程進行采樣，使用激光塵埃粒子計數器進行數據檢測，依照凈化等級標準核定數據，以此判斷凈化無塵車間工程的潔凈度是否合格。

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   凈化無塵車間工程的先期設計不合理，是保證凈化無塵車間工程潔凈度達標的重要因素，合理的設計可以使工程在達標的情況下節省不必要的成本。常見的設計問題有：工程分區模糊，即高潔凈度空間與低潔凈度空間沒有合理分區；沒有合理規避障礙物，致使障礙物造成渦流現象，影響潔凈度；人員走動路線規劃不合理，造成了人員攜帶粉塵的大面積污染。
   偷工減料這種現象常見于低級別凈化無塵車間工程，一些施工方為了獲取工程惡意競爭，刻意將工程報價調低，在施工過程中偷工減料，以次充好，使用較低功率的凈化設備，致使凈化面積與實際施工面積不符，降低潔凈度，導致凈化無塵車間工程不合格。

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   此外，也有一些低檔凈化設備來替代高等級的凈化設備情況，例如萬級的凈化車間僅采用亞高能效空氣過濾器代替高能效空氣過濾器，導致潔凈度不達標。劣質施工無塵車間工程，在驗收時，當發現同一系統中的某個房間或者局部潔凈度不合格，大概率是送風管或者過濾器的密封問題。施工時，要精細密封送風管和過濾器，粗制濫造的施工無法保證各個細節的施工水準，導致送風管與過濾器的泄露。
   調試問題是凈化無塵車間工程的重要環節，編筐編簍全在收口，在凈化無塵車間工程施工完畢后，要進行全部的調試，這里還要特別注意回風口的調試，回風口阻力過大，回風量小于送風量會造成潔凈度不合格。